【报告题目】低蛋白质动力学的多尺度理论与计算模拟
【报告人】李文飞 南京大学物理学院
【时间】2023年10月18日(周三)下午14:30-15:30
【主办方】浙江光电子研究院 浙江师范大学
【线下地点】光电子研究院302报告厅(北山路285号)
【报告摘要】复杂生命过程在分子层次上主要表现为蛋白等生物分子机器的组装与功能运动。近年来,随着结构生物学技术以及基于深度学习的结构预测算法的发展,人们已经积累了丰富的关于蛋白质等生物分子机器的结构信息。然而,这些生物分子机器如何组装、运转,从而实现转录调控、物质输运、催化等生物学功能仍很不清楚,也是目前生物物理领域人们关注的核心问题。回答这些问题依赖于对其动力学过程的精确表征。报告人将结合相关具体工作,介绍多尺度计算模拟方法在蛋白质组装与功能动力学研究中的应用,包括单分子酶催化动力学、金属离子调控的蛋白质组装与别构动力学、细胞粘附的力学调控机制、以及生物大分子液液相分离等,尝试从物理的角度理解自然界生物分子机器为实现高效而精巧的生物学功能所采取的策略。
【报告人简介】李文飞,南京大学物理学院教授、博士生导师,入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”。2004年于中科院近代物理研究所读博士学位;2004-2006年在南京大学物理学院做博士后,开展理论与计算生物物理研究;2006年开始在南京大学物理学院工作;期间于2008-2010年在日本京都大学做博士后;2017-2018年在美国国立卫生研究院(NIH)做访问学者。主要研究兴趣包括蛋白质等生物大分子的折叠组装与功能动力学、酶催化物理机制、以及多尺度理论与计算方法等。主持国家自然科学科学基金4项,发表学术论文60余篇,包括4篇PNAS,3篇Nature Comm.,1篇PRL,1篇JACS等第一/通讯作者论文。